Матрица: Перезагрузка

После победы над агентом Смитом Нео, Тринити и Морфеус продолжают борьбу с машинами, но теперь ставки выше: армия Стражей прокладывает путь к Зиону - последнему городу свободных людей. На советском собрании Морфеус призывает не поддаваться страху и верить в избранного, однако командующий Локк предпочитает полагаться на расчёт и приказывает кораблям вернуться в город. Нео тем временем мучают тревожные видения: он видит, как Тринити падает с высоты, и понимает, что его сила не даёт власти над будущим. Чтобы узнать, что происходит, он встречается с Оракулом. Та объясняет, что путь к Источнику - сердцу системы - лежит через Мастера ключей, которого держит у себя загадочный Меровинген. Пока Нео ищет способ добраться до него, жители Зиона собираются в подземных залах на прощальный танец: на фоне тревожных приготовлений этот праздник напоминает, ради чего люди готовы сражаться. Морфеус, Тринити и Нео отправляются в Матрицу, где их ждут не только агенты, но и новые правила игры. Смит, утративший прежнюю роль, научился размножать себя, превращая людей и программы в собственные копии; теперь даже привычная победа над ним может обернуться ловушкой.

Меровинген соглашается отпустить Мастера ключей лишь после вмешательства своей жены Персефоны: она помогает героям в обмен на поцелуй Нео, похожий на тот, которым он целует Тринити. После побега начинается погоня по скоростному шоссе: Морфеус вступает в схватку с близнецами-охранниками, Тринити пытается уйти от преследователей, а Мастер ключей прокладывает путь к зданию Источника. Эта масштабная сцена стала одной из самых знаменитых в фильме: для неё построили специальный участок дороги на территории бывшей военно-морской базы в Аламеде, а трюки сочетают реальные автомобили, хореографию боёв и компьютерную графику. Добравшись до Архитектора, создателя Матрицы, Нео узнаёт, что его избранность - часть механизма контроля. Зион уже уничтожали пять раз; каждый прежний избранный возвращался к Источнику, выбирал нескольких людей для основания нового города и тем самым запускал очередной цикл. Нео предлагают повторить этот выбор, но он предпочитает спасти Тринити, хотя Архитектор предупреждает: отказ может привести к гибели всего человечества. В Матрице Нео успевает вырвать пулю из её тела и вернуть её к жизни, а затем герои покидают город. В реальном мире Нео неожиданно останавливает приближающихся Стражей одной лишь волей, после чего падает без сознания. Его и членов экипажа подбирают, но выясняется, что Бейн, один из людей на борту, уже захвачен сознанием Смита. Фильм заканчивается тем, что Нео и Бейн лежат без сознания рядом; исход их противостояния остаётся неизвестным. «Матрицу: Перезагрузку» сняли братья Вачовски как продолжение истории 1999 года и производили одновременно с третьей частью, «Революцией»: это позволило перенести финал конфликта в следующий фильм, оставив здесь главное открытие - выбор Нео способен нарушить порядок, который прежде казался неизбежным.